徐若萱主演的电影有《旋风小子》《云水谣》《非诚勿扰》《赛德克·巴莱》《全城热恋》《人面鱼：红衣小女孩外传》等。
1994年，她与林志颖合作主演了《旋风小子》，在影片中饰演安妮，这是她早期的代表作。2006 年，徐若萱在《云水谣》中与陈坤、李冰冰合作，饰演王碧云，凭借该角色入围了百花奖最佳女主角。2008 年，她参演了《非诚勿扰》，和葛优、舒淇搭戏，饰演台湾空姐。2009 年，她参与了史诗级战争片《赛德克·巴莱》，饰演部落女性。2010 年，在《全城热恋》里，徐若萱与张学友、谢霆锋等合作，共同演绎了爱情故事。2018 年，她主演《人面鱼：红衣小女孩外传》，饰演母亲一角，入围了台北电影节最佳女主角。
此外，她还参演过《特务迷城》《人鱼朵朵》《火龙对决》等作品，这些作品涵盖了动作、文艺、爱情等多种类型。
