昆明市教育科学研究院是昆明市教育体育局直属的全额拨款事业单位，前身为1956年成立的昆明市教育局教研室，2005年更为现名 。机构下设院办公室、教育理论与发展研究室、义务教育教学研究室、高中教育教学研究室、德育体育艺术心理教育研究室、职教与综合实践活动教育教学研究室等部门，代管昆明市中小学生课外科技教育活动中心，实行“两块牌子、一套班子”管理模式 。主要职能涵盖教育科研规划、教学指导评价、质量监测分析及教师培训等，现设有专业技术人员44名，工勤人员6名 。现任领导包括院长吴彦明 。
该院通过组织学科教研活动、统测命题和科技创新竞赛履行职能，2023年开展中高考备考研究、新课标实施等重点工作 。近年与云南财经大学共建基础教育强师强校联盟，强化教师发展共同体建设 。2025年，主办“我是健康小卫士”青少年健康生活科普微视频大赛颁奖活动 。2026年1月，原专职副院长路小军被免职，调任昆明技师学院院长 。
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