抑制基因是指某一突变基因的表型效应因第二个突变基因的出现而恢复正常的遗传学现象。其与回复突变的区别在于不改变原突变基因结构，通过补偿作用使表型正常化，通常以符号Su表示。
抑制基因分为基因内抑制和基因间抑制两类。基因内抑制发生于同一基因内，包括针对错义突变、移码突变及无义突变的补偿机制，典型案例如大肠杆菌色氨酸合成酶A亚基的突变。基因间抑制涉及不同基因间相互作用，具体表现为代谢补偿和翻译校正两种方式，例如粗糙脉孢菌中腺嘌呤缺陷型的代谢调控案例。
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