《瞄准》是一部讲述两个性格迥异的师兄弟，因为信仰和性格的差异，展开相爱相杀的故事。以下是该剧1至57集的剧情概述：第1集：曾思过，一个木雕师，平凡无奇，送孩子上学后去码头上班。码头上，潜伏特务叶冠英与保密局“客人”接头，公安局曹必达设下埋伏。第2集：曹必达对曾思过进行审问，发现他只是掩藏的身份，真正的身份是杀手“水母”的搭档，顶级狙击手“牧鱼”，苏文谦。第3集：曾思过否认自己是“牧鱼”，审问陷入僵局。第4集：曾思过承认自己是“牧鱼”，苏文谦，曹必达震惊。第5集：苏文谦逃跑，曹必达、欧阳湘灵等人紧追。池铁城见苏文谦被捕，气急败坏。第6集：苏文谦伪装成医生，寻找叶冠英。第7集：池铁城警告方校长和崔九，没有人能命令他，也没人能在他水母组面前耍威风。第8集：苏文谦是唯一能破译水母密码的人，李局长决定争取他。第9集：池铁城与小雪成为朋友，承诺小雪达到他的弹弓标准，蛋糕随便吃。第10集：苏文谦拒绝帮助破译密码，曹必达等人无法。第11集：苏文谦和欧阳湘灵就生命与善恶展开辩论。第12集：苏文谦担心秦鹤年中毒与殷千粟回松江有必然联系，决定接受教官请求。第13集：小雪去找苏文谦，遇到池铁城，被池铁城带走。第14集：曹必达判断水母组刺杀目标是文市长，苏文谦心急如焚。第15集：苏文谦与欧阳湘灵大吵一架，决定辞职。第16集：苏文谦看到“灯塔”档案，得知杨之亮是欧阳湘灵的上级，心生愧疚。第17集：花和尚重伤，池铁城禁止单棱给花和尚用消炎药。第18集：苏文谦回忆与池铁城过往，三年前因池铁城欺骗，误杀杨之亮。第19集：苏文谦教专案组了解敌人，水母组行动三大原则。第20集：池铁城将苏文谦铐在轮椅上，约定30秒内无法打开锁，他就逃跑。第21集：池铁城计划引出专案组，趁机打伏击。第22集：曹必达与蒋岚订下理查饭店顶层房间，准备伏击。第23集：殷千粟和文市长希望秦鹤年主和，让第十兵团和平起义。第24集：池铁城得知殷千粟可能坐飞机去衡州，决定在松江码头设伏。第25集：池铁城回忆与紫舒过往，决定施展美男计。第26集：池铁城拿到改装枪管，同时拿走了紫舒的怀表。第27集：苏文谦心事重重，池铁城在松江码头设伏。第28集：欧阳湘灵告诉紫舒苏文谦是重大嫌疑犯。第29集：池铁城与苏文谦在钟表修理店相遇，苏文谦质问老爹为何要杀殷千粟。第30集：第十兵团接到密令，升任廖杰为第十兵团代司令长官，解衡州之围。第31集：殷千粟葬礼，文市长、李局长、曹必达等人抬棺。第32集：池铁城计划制造车祸暗杀秦老。第33集：紫舒回忆1939年，池铁城和苏文谦刺杀白松奇和武藤雄一。第34集：紫舒回忆池铁城在抽签中做了手脚，将赴死位置推给苏文谦。第35集：方晋甫留住了小雪和秦鹤年，欧阳湘灵发现池铁城在监视秦公馆。第36集：暗杀组寻找秦鹤年，单棱下令停止行动。第37集：欧阳湘灵发现苏文谦留给紫舒的信，信中坦白当年真相。第38集：苏文谦提出条件，池铁城同意放弃暗杀任务。第39集：钱珏劝诫廖杰，国防部出尔反尔，第十兵团留守衡州。第40集：池铁城在最后时刻赶到钟表店，表示同意苏文谦的条件，放弃暗杀任务。第41集：小雪叫不出“爸爸”，池铁城不高兴。第42集：苏文谦让紫舒和小雪跟随池铁城离开松江。第43集：秦老与紫舒发生矛盾，紫舒带着孩子离开。第44集：秦鹤年、紫舒母女上船，苏文谦与之遥望，心中不舍。第45集：钱珏赶往火车站，希望截停火车，拦下庄廷凤，但火车已开。第46集：方晋甫告诉李北筏，池铁城为私情违背杀手准则。第47集：池铁城感觉必须有帮手完成刺杀行动，决定找苏文谦。第48集：苏文谦被救醒，拒绝池铁城，但池铁城带他去看欧阳湘灵。第49集：苏文谦向老爹求助，阻止池铁城杀害特使。第50集：苏文谦告知欧阳湘灵真相，他们并不知道特使身份。第51集：欧阳湘灵被送上车，苏文谦告诉她逃跑方法。第52集：方校长点燃汽油蜡烛，说池铁城下令杀了欧阳湘灵。第53集：公安局抓获特务，但未围捕水母组，担心特使不敢登门。第54集：小雪决定将苏文谦的信放回原处，丢掉不开心的事情。第55集：庄廷凤等待电话，对方让他去电话亭。第56集：医院，苏文谦收到老爹和欧阳湘灵留下的东西。第57集：池铁城发现松江电台取消节目，意识到秦鹤年真正要去的是洋浦电台，连忙阻止。
