吴啊萍供奉侵华日军战犯牌位是出于个人错误认知与自私动机，未受人指使或与他人共谋。具体原因及事件详情如下：
心理阴影与错误认知：吴啊萍到南京后了解到侵华日军战犯暴行，产生心理阴影，长期被噩梦缠绕。接触佛教后，产生通过供奉战犯“解冤释结”“脱离苦难”的错误想法。
对魏特琳的扭曲理解：了解到魏特琳在南京大屠杀期间保护女性的善举，但因受战争刺激回国后自杀，吴啊萍想通过供奉帮其解脱。
个人动机与行为性质：吴啊萍出于对因果释结的错误认知和自私自利的动机，在明知被供奉者为战犯的情况下仍出资设置牌位，严重违背佛教教义教规，破坏公共秩序，伤害民族感情，涉嫌犯寻衅滋事罪。
对吴啊萍的处理：吴啊萍已被公安机关刑事拘留，案件正在进一步审理中。
对玄奘寺及相关责任人的处理：玄奘寺因未核查被供奉者身份且隐瞒不报被责令整顿，主要负责人传真被撤换职务；市佛教协会免除其副会长职务。市及玄武区宗教事务管理部门多名责任人因失管失察被依纪依规依法处理，包括诫勉、免职、党内警告等处分。
