南京交院站位于南京市江宁区龙眠大道与格致路交叉路口南侧，是南京地铁1号线的一座高架三层侧式车站，由南京地铁运营有限责任公司运营。车站沿龙眠大道南北方向布置在路中8米绿化带上方，主体二层为站厅层，三层为站台层，总建筑面积5851.7平方米。东西两侧各设1个出入口共2个，设置在人行道上，设备管理用房位于西侧地块 。
该站邻近南京交通职业技术学院、江苏海事职业技术学院等院校，周边分布有方山风景区。作为江宁大学城区域重要交通节点，该站主要服务于师生的出行需求，可直达南京南站、南京火车站及市内主要商圈 。
2026年3月，南京地铁一号线机电设备焕新工程迎来重要节点，南京交院站率先开展垂直电梯等核心设备更新，站内三台垂直电梯已完成一台 。
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