温州医学院基因组医学研究院（Institute of Genomic Medicine, Wenzhou Medical University）成立于2009年3月22日，是温州医科大学（原温州医学院）领导下的科研机构，定位为国内首个基因组医学研究院。研究院建有生物样本收集库及功能基因筛选、表观遗传学、转基因模式动物构建三大技术平台 ，首任院长为孙中生 。
研究院聚焦复杂疾病的遗传基础及机制研究，早期重点涉及甲状腺、心血管等疾病。研究院承担国家“973”、“863”项目及国家自然科学基金等课题，并与阿斯利康等签署合作协议 。其名称后随大学更名调整为温州医科大学基因组医学研究院，院长后由苏建忠担任 。
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