《神探狄仁杰第二部》由《关河疑影》《蛇灵》《血色江州》三个独立又关联的故事构成，融合悬疑推理、权谋斗争与情感纠葛，展现了狄仁杰团队在复杂局势中抽丝剥茧、揭露真相的过程。
故事以武周年间契丹犯境为背景，狄仁杰奉命调查边军战败真相。核心矛盾在于战场信息被系统性篡改：契丹宣战后，王孝杰率军正面迎敌，赵文翙部借道突厥迂回，但贺兰驿被紫衣人（蛇灵组织）占领，所有塘报被替换为虚假捷报。武则天收到的战报虽内容详实，却暗含绝密信息且作战计划反常，狄仁杰由此察觉异常。
调查中，王孝杰主力全军覆没、赵文翙失踪、发报士兵接连失踪、丘静拒绝提供物资等线索逐渐串联。关键转折点在于王铁军携带真实塘报被追杀，狄如燕救下他后委托曾泰送信，曾泰半路被无影针下毒昏迷，假曾泰刺杀狄仁杰未遂。狄仁杰通过比对幽州案与本案手法，锁定蛇灵组织为幕后黑手，最终揭露王孝杰手下与紫衣人勾结、苏宏晖是契丹内奸的真相。此案凸显了信息战对战争走向的决定性影响，以及权力斗争中人性与忠诚的考验。
故事围绕蛇灵组织策划的刺杀行动展开，但具体剧情因资料有限未详述。从设定看，蛇灵作为贯穿全剧的反派势力，其核心目标是颠覆武周政权。该案可能涉及多重身份伪装、密室杀人等经典悬疑元素，同时展现狄仁杰团队如何通过逻辑推理与现场勘查，破解逆党精心设计的陷阱。此单元或进一步深化狄仁杰“政客”属性——他需在维护法理与权衡人情间抉择，甚至为政治目的调整调查方向。
江州频发血案，狄仁杰与李元芳通过现场痕迹、证人证词等线索，逐步拼凑出真相。此案不仅包含悬疑推理，更聚焦于“法理”与“人情”的冲突。例如，狄仁杰在追查真凶时，可能面临保护无辜者与严惩罪犯的道德困境，甚至因此二度辞官隐退。这一情节反映了他在理想主义与现实政治间的挣扎，也使角色形象更具层次感。
剧中角色性格鲜明：狄仁杰（梁冠华饰）以智慧与权谋平衡法理与人情；李元芳（张子健饰）以武艺与忠诚守护正义；狄如燕（姜昕言饰）从蛇灵杀手转变为正义伙伴，与李元芳的感情线增添温情；武则天（吕中饰）与狄仁杰的君臣关系微妙，既依赖其才能又防范其权力。此外，曾泰的师生情、肖清芳的野心等支线，共同构建了复杂的权力网络。
该剧突破传统悬疑剧框架，将恐怖元素（如紫衣人、无影针）与情感戏码（爱情、师生情、君臣情）融合，使故事张弛有度。狄仁杰的“政客”属性被重点刻画——他并非完全正派，而是根据政治目的调整决策，这种复杂性使其形象更贴近历史真实。江州案后，他的辞官隐退象征着对理想与现实矛盾的无奈，深化了“权力与人性”的主题。
