把修复不好或者死亡的细胞代谢出体外并非由单一的酶来完成，而是涉及多种酶协同作用。1. 蛋白酶体相关酶类：细胞内存在蛋白酶体，它含有多种蛋白酶活性成分。当细胞内蛋白质出现错误折叠、损伤或者细胞走向凋亡时，这些蛋白酶体中的酶会将蛋白质降解为小肽段，进而逐步代谢，参与细胞内蛋白质质量控制和细胞成分的更新。2. 溶酶体酶：溶酶体是细胞内的“消化车间”，含有多种水解酶，如蛋白酶、核酸酶、脂肪酶等。当细胞发生凋亡或者有损伤的细胞器、细胞碎片等需要清除时，溶酶体膜破裂释放出这些酶，将细胞内的大分子物质水解成小分子，最终排出细胞外，实现对死亡细胞和细胞内垃圾的清理代谢。
