中国人民解放军第二炮兵指挥学院的历史沿革如下：
创建与更名：学院建立于1977年11月，最初命名为第二炮兵学校。1979年5月，更名为第二炮兵学院。1986年6月，正式定名为中国人民解放军第二炮兵指挥学院。
学位授予权：1990年，学院获得军事学硕士学位授予权。1993年，被批准为博士学位授予单位。1998年，再次获得军事学博士学位授予权，并具有单独招生权。
学科发展与招生：为了适应未来高技术战争的需要，从1994年起，学院开始招收地方优秀的应届高中毕业生，以培养高素质的跨世纪中初级指挥人才。1996年，“导航、制导与控制”、“兵器发射理论与技术”两个学科被确定为全军重点学科。1999年起，“通信技术指挥”和“国防工程建筑技术指挥”专业也开始招收地方优秀的应届高中毕业生，接受四年制大学本科教育。
培训层次与学科专业：目前，学院的培训层次包括博士、硕士、本科、大专、中专。开设了44个学科专业，其中第二炮兵战役学科被确定为全军重点学科。此外，还有军种战役学、军事后勤学、军队政治工作学、军事装备学、军事通信学等8个军事学硕士学位授权点和军种战役学博士学位授权点。
