巴中市卫生局的领导层分工如下：
张映军局长：全面负责市卫生局的行政管理工作，联系的部门有市中心医院、卫生统计信息中心和市医学会。
马云党委书记、副局长：分管新型农村合作医疗、农村卫生管理科、妇幼保健与社区卫生科以及人事科。联系单位包括平昌县卫生局、市妇幼保健院、市卫生经济学会和市女医师协会。
赵俊明副局长：主要负责医政与医疗服务监管科、中医科、科技教育科、行政审批科和市无偿献血领导小组办公室。联系单位有通江县卫生局、市中心血站、市中医药学会和市护理学会。
方明恒副局长：负责卫生应急办、疾病预防控制科、卫生监督科、食品安全综合协调科以及市爱国卫生运动委员会办公室和健康教育、环境综治工作。联系单位包括南江县卫生局、市疾控中心、市卫生执法监督支队和市卫生协会。
李玉纪委书记：主要负责纪检监察和行风建设工作，分管局办公室、监察室、审计、安全、维稳和信访工作，与巴州区卫生局保持沟通。
蒲仕强、何少华、张修琼：均为调研员，各自承担调研任务。
蔡燕副调研员：协助马云管理相关的科室和工作，具体联系的单位未详述。
石友宣副调研员兼中医科长：协助赵俊明管理中医科和科技教育科，并与市中医药学会保持联系。
尹仕文副调研员兼规财科长：协助局长负责规划财务和项目管理工作，与市卫生技术管理中心保持联系。
