《誓言无声》讲述了20世纪60年代我国反间谍部门为保障新型潜艇研究制造项目安全，与台湾间谍展开激烈斗争的故事。
故事起始于20世纪60年代的一个冬天，秘密回国参加新型潜艇研究制造的华裔专家，在途经香港时遭遇危机。来自欧洲的华裔舰艇动力专家在香港等候北京方面的接应者张晓明时，突然遭到台湾特务袭击。专家本人侥幸脱险，但与他同行的两个学生却不幸被杀害。这一事件引起了北京反间谍局的高度重视，他们立即分析情况，判断内部存在台湾间谍，并迅速展开调查。
与此同时，总部侦察员骆战等人正在红旗宾馆严密监视一个刚刚潜入北京的敌特。该监视对象虽无动静却匆匆离开北京，而另一个长期被监视的特务——红旗宾馆服务员毛阳浮出水面。这一系列情况让局势更加复杂。
在香港，张晓明未能接应到专家且遭敌特跟踪，他立即与总部驻外机构负责人朱学峰紧急见面并汇报情况。朱学峰让张晓明隐蔽待命，自己则迅速向北京总部汇报。总部反间谍专家许子风被带到郊外射击场，与骆战一起被告知香港发生的事件及其背景，得出内部有间谍的结论。许子风和骆战接受任务，要尽快找出间谍，确保“512项目”顺利完成。许子风感到事情不简单，立即命令骆战转移办公地点。
鉴于香港情况复杂，朱学峰约见外派人员蓝美琴，传达北京总部指示，让她先接替张晓明护送华裔专家安全入境，随后回北京协助许子风的工作。一场惊心动魄的反间谍斗争就此展开，各方势力在这场没有硝烟的战争中斗智斗勇。
