基因表达谱是在特定状态下细胞或组织中基因转录表达模式的整体描述 。其获取方法包括基因芯片技术和HiMAP-seq（多重和并行测序技术）。HiMAP-seq可在单次反应中对数千样本的转录组进行高通量检测，在通量、速度和成本上优于传统RNA测序方法 。
基于基因表达谱的分子分型已应用于乳腺癌 、弥漫性大B细胞淋巴瘤 等疾病的亚型区分。90基因表达谱检测可用于原发不明肿瘤的组织起源判定并指导治疗 。研究利用HiMAP-seq技术建立了中药化合物扰动基因表达谱数据集，并整合构建了CIGS数据库，包含13,221种化合物、93,664个基因表达谱及3.19亿条化学扰动数据 。该数据库通过交互式在线平台向全球开放 。
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