南京禄口国际机场南京南站城市候机楼位于南京市雨花台区南京南站一楼南京汽车客运南站旁 ，面积606平方米 。2018年12月11日投入试运行 ，开放时间为每日7:00至21:00 。该候机楼整合高铁、机场资源，提供问讯、售票、值机、航班信息查询、候机、预安检、行李托运及机场巴士等服务 ，旅客托运行李后可直接前往禄口机场安检候机 。候机楼每日开行至机场大巴半小时一班，首末班车分别为7:00和21:00 。乘坐当天国内航班（除九元、春秋等廉航）及部分国际航线的旅客，可最迟在航班起飞前2小时办理托运行李 。
截至2019年春运前，该候机楼已累计发送旅客1.3万人次，行李托运量超51吨 ；截至2019年6月，累计运送旅客突破3万人次，办理值机超过2万人次，托运行李突破1万件 。2019年春运期间，单日发送旅客最高达753人 。乘坐高铁到达南京南站的旅客，出示24小时内非南京区域抵达南京的高铁车票，且高铁票价格高于机场大巴公布价（25元）、24小时内有禄口机场出港航班计划的，可免费乘坐前往机场的大巴 。2026年春节期间，其运营时间调整为2月16日（除夕）至2月17日（初一）7:10-14:40，2月18日（初二）起恢复正常 。该候机楼服务范围通过高铁网络延伸至苏皖地区，服务人口规模约5000万 ，实现了禄口机场与高铁、长途客运的衔接 。
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