分集剧情如下：
第1集：顺治即将大婚，表妹科尔沁公主送给皇帝的礼靴中藏有针梃，扎破了皇帝的脚。太后命人严查，宫女翠果儿和太监小鲁子因此获罪身亡。皇帝借机退婚，但最终在太后的坚持下，与表妹成婚。
皇帝在大婚前受惊吓，洋神父汤若望帮助他克服恐惧，同意婚事。大婚前，皇帝请求赦死囚、减赋税、奖将士、封郡王，被太后拒绝。最终，皇帝迎娶表妹博尔济吉特氏。
大婚之夜，天空电闪雷鸣，天安门遭雷击，宫灯失火。太后斟酒敬天，却在雨夜中含泪乞求保佑儿子。皇后脾气暴躁，经常对宫女和物品发脾气，让皇帝十分不满。太后教导皇后如何做一个称职的皇后，并劝说皇帝看望生病的皇后。
太妃请求太后让儿子博果尔参加议政会，太后拒绝。郑亲王因博果尔议政受阻心中不快，劝皇帝要顶天立地。皇帝在一次秋猎中淘气，导致众臣不满，也激怒了郑亲王，后者主张皇帝应亲自观看秋决刑场。
郑亲王夜访太妃府，劝其不要争强好胜。太后与郑亲王对博果尔的态度迥异，使皇帝感到为难。皇后在雨夜与皇帝争吵，指责皇帝不像皇上，深深地刺伤了皇帝。
秋决观刑使皇帝颤抖呕吐，他仁慈宽厚，恐惧并憎恶血腥场面。在一次秋猎中，皇后再次使性子，皇帝将喜爱的宫女花束子扶上马，并允诺册封她。花束子已有身孕，这引起太后不满，欲将她调离出宫。
皇帝让花束子在自己的大帐里养伤，皇后让她滚出去。皇帝赶来制止，并告诉她花束子已有身孕，永远也不出宫了。皇后为了掩盖罪行，与太妃结成同盟。
安巴度得知女儿怀了龙种，喜不自禁，醉酒后要闯入皇上行宫，被鄂硕将军拿下。太后闻讯赶来，赏赐安巴度良田、房屋和官职，安巴度抱住太后大哭，言行举止十分不雅。
太后对花束子怀有身孕一事心有疑虑，皇后将麝香加入药方，导致胎儿被打落。皇帝迁怒于内务府总管索尼，令他将后宫的事情交太监吴良辅处理。索尼向太后禀报皇后所为，太后令索尼与太医缄口。
皇帝为听不到实话、真话而苦恼。皇后为了掩盖罪行，与太妃结成同盟，将“麝香”一事隐藏起来。皇后为掩盖罪行，与太妃结成同盟。
《少年天子》，作家凌力的代表作，是一部描绘清朝入关后第一代皇帝顺治的长篇历史小说。面临明、清鼎革之际的严峻局面，顺治励精图治，力求变革；但不断受到朝廷保守势力的阻挠政治风云迭起。顺治能书会画，多情善感，醉心追求符合意愿的爱情和婚姻生活；但皇帝的爱情和婚姻牵连着宫廷权力的争夺，顺治在这方面的举措也引起了爱与恨、生与死的尖锐矛盾。终其二十三、四岁的一生，顺治在政治上的失败和爱情上的破灭，反映了深刻的性格悲剧和历史悲剧。
