1. 初音岛的传说在新月形的岛屿上展开，整年盛开的樱花使它闻名。主人公朝仓纯一在风见学园学习，拥有一种特殊能力：在梦中观看他人的梦境，并能施展老魔法使教授的制作点心的魔法。某夜，纯一在梦中重逢了童年时的“妹妹”，却记不起她的名字。2. 纯一的美梦被妹妹音梦的恶作剧打断，尽管她行为古怪，纯一仍对她宠爱有加。他们并非血缘兄妹，音梦自幼被朝仓家收养。纯一细致入微地照顾音梦，这种亲密的关系让人误以为他们是恋人。3. 学校的偶像白河小鸟和音梦的好友美春是纯一和音梦的同班同学。新学期开始，一位转学生陆铅登场，她竟是纯一梦中的妹妹——芳乃樱。芳乃樱的到来让纯一感到惊慌，音梦则感到不安。4. 纯一的恐慌得到了证实，因为芳乃樱 declare her intention to fulfill a promise with her brother. Unable to cope with her passionate advances,纯一试图用变出的点心分散她的注意力，但芳乃樱还是在纯一不注意时偷吻了他。音梦恰好推门而入，看到这一幕，愤怒地离家出走。5. 樱花树常年盛开的初音岛，朝仓纯一与音梦虽非血亲，却如家人般相依为命。纯一的能力在平凡的生活中不为人注意，直到青梅竹马芳乃归来，他才开始意识到音梦对他的感情可能超越了亲情。6. 随着时间的推移，纯一、音梦和芳乃三人在樱花树下聚首，最终解除了持续的魔法。芳乃选择放手，而纯一和音梦的关系发展成了婚姻。7. 53年后，初音岛和风见学园依旧，新的爱情故事在这里展开。樱内义之，住在芳乃樱家的主人公，过着平凡而充实的校园生活，身边围绕着一群可爱的女生。8. 义之的生活随着春天的到来和樱花的绽放而改变。经过一番波折，天枷美夏的机器人身份被揭露，但在同学们的尊重下，她赢得了毕业典礼。9. 在D.C.故事的53年后，初音岛被粉红色的樱花花海覆盖，冬季的雪花与樱花共同飘落。义之感受到岛上发生了某种变化，而小樱作为魔法使，决定牺牲自己的魔法来纠正樱花树的魔法失控问题。10. 最终，樱花树枯萎，义之也逐渐从人们的记忆中消失。音姬在弟弟的劝说下，牺牲了自己的感情，完成了让樱花树枯萎的任务。小樱在树内苏醒，见证了大家虽然忘记了义之，却总觉得失去了什么。她用最后的魔法实现了大家的愿望，让义之复活，樱花树从此消失，故事以温馨的团聚结束。
