泰州市国家税务局的机构设置主要包括内设机构、直属机构、事业单位、派驻机构和所属市、区国家税务局。
内设机构： 办公室：负责日常政务、文电处理等多项行政事务。 政策法规处：负责税收政策法规的调查研究和涉税法律事务。 流转税管理处：负责流转税税政业务和增值税专用发票管理。 所得税管理处：负责所得税税政业务和财务制度管理。 国际税务管理处：负责国际税务事项管理。 进出口税收管理处：负责国家进出口税收政策及管理办法的实施。 征收管理处：负责税收征管法律、法规的执行和征管质量考核。 计划统计处：负责税收计划管理、税收会计和统计分析。 财务管理处：负责经费、财务和资产管理工作。 人事教育处：负责人事管理制度研究和教育培训规划等工作。
直属机构： 稽查局：负责组织税收检查工作，包括重点税源企业和税务违法案件的查处等。
事业单位： 信息中心、机关服务中心、票证中心：分别负责信息系统建设、后勤服务和税收票证管理等。
派驻机构和所属市、区国家税务局： 泰州市国家税务局共派驻2个正科级税务分局，并设有泰州经济开发区国家税务局、靖江市国家税务局、泰兴市国家税务局、姜堰市国家税务局、兴化市国家税务局等所属市、区国家税务局。这些机构负责税务登记、税款征收等多项税务工作，确保税收政策的有效执行和税收管理的高效运行。
