盐阜军区是抗日战争时期新四军在苏北盐阜地区组建的军事机构，1941年9月13日正式成立 。其前身可追溯至1940年八路军第五纵队开辟盐阜抗日根据地时的军事力量布局 。初成立时隶属新四军第三师建制，由洪学智担任首任司令员 。军区通过"主力部队地方化"方针，将新四军第三师主力团编入地方武装，建立起覆盖盐城、阜宁等县的游击武装体系 。
1942年成为军区建设的关键时期，6月组织千余人军事骨干集训并由陈毅等领导人检阅 ，10月举行成立周年阅兵式时管辖武装力量达5000余人。1941年9月13日成立盐阜军区，1942年12月改编为盐阜军分区 ，1943年1月正式划归苏北军区建制 ，完成其作为独立军区的历史使命。
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