吴石没有葬在八宝山，主要受安葬标准、身份保密、牺牲地点及历史节点等因素影响。
首先，八宝山安葬有严格标准和名额限制。八宝山革命公墓作为我国规格最高的安葬场所，主要安葬已故党和国家领导人、民主党派领导人、爱国民主人士、著名科学家、文学家、高级工程技术人员等，并非所有英雄都能安葬于此。吴石虽为隐蔽战线的英雄，但可能因安葬标准限制，未能入葬八宝山。
其次，吴石牺牲时身份特殊，需严格保密。吴石是隐蔽战线的杰出代表，牺牲时其真实身份是绝对机密。若当时高调安葬在八宝山，会暴露其身份，危及在台湾的地下情报网。为保护更多潜伏战友，组织决定“生要隐名，死要藏迹”，其事迹被封存多年，这也影响了其安葬地点的选择。
再者，牺牲地点与遗体运输困难。吴石牺牲在1950年的台湾，当时台湾在国民党控制下，与大陆几乎断了联系。要把遗体运回大陆不现实，且国民党不会轻易让其遗体离开台湾。他最初被秘密安葬在台北乱葬岗，1973年遗骸才迁到现址，这也使得他无法在牺牲后立即安葬在八宝山。
此外，历史节点影响安葬选择。1991年缪希霞在福田公墓为吴石立墓时，因历史节点等原因未选择八宝山。1993年吴石骨灰迎接回大陆后，与夫人王碧奎合葬在福田墓园，这也成为他最终的安息之地。
