派遣证和报到证的主要区别体现在持有方式、性质及作用、发放形式和处理原则等方面，具体如下：
派遣证：个人不能持有。毕业生毕业后，派遣证会放入毕业生本人的档案，由国家直接打到派遣单位。如果用人单位拥有档案保存资格，毕业生档案就放在单位；如果没有，单位会将毕业生档案放在人才市场类的档案保存处；若毕业生没工作，档案就直接打回原籍。
报到证：可以个人持有，交由本人自行保管。
性质及作用
派遣证：在以前大学毕业后国家分配派遣工作时使用，是毕业生档案流转的重要依据，随着档案由国家统一派遣至相应单位或机构，不直接面向毕业生个人发挥报到功能。
报到证：由原来的派遣证转化而来，是应届普通高等学校、应届普通中等专业学校（普通全日制，也就是统招生）毕业生到就业单位报到的凭证，也是毕业生参加工作时间的初始记载和凭证。毕业生到就业单位报到时，须持“报到证”。学校相关部门依据“报到证”为毕业生办理档案投递、组织关系转移和户籍迁移等手续，就业单位所在地公安部门凭“报到证”为毕业生办理落户手续，就业单位凭“报到证”为毕业生办理相关工作手续。
发放形式
派遣证：一式两份中的一份，与报到证共同构成毕业生就业派遣的完整文件体系，但派遣证部分存入档案，不直接发放给毕业生。
报到证：作为派遣证的配套文件，直接发放给毕业生本人，用于办理就业报到相关手续。
就业后处理原则
派遣证：
落实到省直和中央驻各省单位就业的毕业生，派遣证直接派往接收单位。
落实到市、州所属单位就业的毕业生，派遣证派到单位所属市、州大中专毕业生就业指导办公室（师范类专业的毕业生，派往单位所属市、州教育局），其备注栏内注明接收单位名称。
落实到回生源地择业的，派遣证将派回生源所在省的毕业生就业主管部门。
报到证：主要作为毕业生到就业单位报到的凭证，不涉及根据就业单位类型进行分类派遣的处理流程，但需根据派遣证确定的派遣方向，由毕业生持报到证到相应单位或部门办理报到手续。
