《刑侦12》中杨芷菲的最终结局为被刑凯救出，与刑凯修成正果，但情感上更倾向刑凯分裂出的“阿贤”人格。
在《刑侦12》大结局的情节设定中，杨芷菲遭遇了极为惊险的危机，她被傅洋山囚禁，并且傅洋山企图让她顶替自己。这一情节充满了紧张与危险，将杨芷菲置于生死边缘。不过，幸运的是，刑凯及时出现，凭借自身的智慧和勇气，成功地将杨芷菲从傅洋山的魔掌中解救出来，使她脱离了危险，重获自由。
获救后的杨芷菲，在情感上与刑凯有了进一步的发展，两人最终修成正果。刑凯在经历了一系列事件后，其人格发生了融合。尽管杨芷菲心里真正喜欢的是刑凯分裂出来的“阿贤”人格，但刑凯人格融合后，她还是接受了刑凯，两人走到了一起。这种情感上的转变和接纳，既体现了杨芷菲对刑凯的复杂情感，也反映出在经历诸多磨难后，她对现实和情感的重新审视与选择。
杨芷菲在面对刑凯人格融合这一情况时，展现出了豁达和乐观的态度。她不仅接受了刑凯人格融合后的状态，还替刑凯感到高兴，甚至调侃刑凯整合人格后变得更加健全了。这种态度不仅体现了她善良、开朗的性格特点，也从侧面反映出她对刑凯的深厚感情，愿意以积极的心态去面对刑凯的变化，共同迎接未来的生活。
