大陆没有组织刺杀蔡孝乾，主要受当时客观形势和行动成本等因素限制，具体原因如下：
其一，地下组织遭受毁灭性打击，无力组织刺杀。蔡孝乾作为台湾地下党最高负责人，掌握着所有核心机密，包括组织名单、联络方式及交通线。其被捕后迅速叛变，导致国民党根据其提供的情报展开大规模清剿。我方在台湾的地下组织几乎被连根拔起，幸存同志的首要任务是隐蔽身份、躲避追捕，自身安全尚难保障，根本无法组织高难度的刺杀行动。例如，许多地下党员被迫转移或潜伏，与组织失去联系，短期内难以形成有效的反击力量。
其二，刺杀行动成本极高，实施难度极大。当时台湾处于白色恐怖统治下，国民党对蔡孝乾实施了重点保护，其活动范围和安全措施均受到严格管控。要重新派遣人员潜入台湾，需突破层层封锁和监视，且需精准掌握蔡孝乾的行踪，这在技术手段有限的年代几乎难以实现。此外，刺杀行动本身需要周密的策划、专业的训练和充足的资源支持，而当时大陆方面在台湾的情报网络已遭严重破坏，缺乏必要的行动基础。例如，国民党特务机构对叛徒的保护机制极为严密，任何可疑人员接近蔡孝乾都会立即引发警觉，导致行动暴露。
其三，刺杀可能引发更严重的政治后果。在国民党统治区，刺杀叛徒虽能起到震慑作用，但也可能被当局利用为镇压的借口，进一步加剧对地下党员的搜捕和迫害。此外，刺杀行动本身存在风险，若失败可能导致更多同志暴露，甚至引发连锁反应，使地下组织遭受更大损失。因此，从战略角度考虑，保存有生力量、避免无谓牺牲成为更优先的选择。
