《战旗》第一集和第二集分集剧情如下：
第一集：
金戈归国与职位安排：金戈从美国留学归来，担任晋绥军852团特战大队队长。然而，团长肖百川对金戈心生嫉妒，暗中与日军长官龟井次郎勾结。肖百川以让金戈回家结婚为由，将其调离防线，企图借日军之手除掉金戈。
戴金花伏击与误会：龟井次郎在前往东安城的路上，遭到冀中游击队女队长戴金花的伏击。戴金花得知是金戈撤走了驻防部队，误以为金戈是汉奸。当夜，她带领队员到金家锄奸，却发现金家只有金母、金戈的胞兄金玉和未婚妻柳文婷。两名日本特务也潜入金家，戴金花成功解决了一个，但险些被另一人的飞镖所伤，幸得金母开枪相救。
金戈计谋与成功反击：所谓结婚其实是金戈的计谋，他故意放出假结婚的风声，目的是声东击西，端掉日军炮兵阵地。金戈将特战队员分成三组，一组和二组用机枪组成火力网压制敌人，自己则带着三组的战士以大炮正面迎击日军。最终，一枚炮弹成功射出，炸飞了龟井二郎，鬼子的流苏旭日军旗也灰飞烟灭。
第二集：
金戈谢罪与暗中怀疑：金戈为擅自发动偷袭向肖百川谢罪，但暗中怀疑是肖百川走漏了消息。与此同时，他与柳文婷正式结婚。
钱柏豪劝阻与婚礼危机：婚礼前一晚，茂发洋行总经理钱柏豪来到金家。他表面经商，实则是国民党特工。钱柏豪向东安城危在旦夕的形势，劝金戈不要举行婚礼，但金戈并未听从。婚礼当天，肖百川将日军引向东安城抓捕金戈。
钱柏豪救援与身份暴露风险：在危难中，钱柏豪带着柳文婷出城，过程中差点暴露自己是军统的身份。
