首先，我们来理解“半夜三更”这个表达。在中文里，“半夜三更”通常指的是深夜时分，特别是在古代计时方式中，“三更”指的是晚上十一点到凌晨一点这个时间段，是夜晚最为深沉的时候。
接下来，我们需要将这个时间与十二生肖进行关联。在十二生肖中，每个生肖都与特定的时间或时段有所关联，这种关联往往来源于古代的计时方法和人们对生肖特性的观察。
其中，有一个生肖与夜晚紧密相关，那就是“鼠”。在十二生肖的排列中，鼠是第一位，这与其在子时（即深夜十一点至凌晨一点）最为活跃的特性有关。古代人们认为，鼠是在这个时间段最为频繁活动的动物，因此将其与这一时段相联系。
综合以上分析，我们可以推断，“半夜三更”所指的生肖是“鼠”。这个推断基于鼠与夜晚的紧密联系，以及“半夜三更”所代表的深夜时段。所以，答案是鼠。
